MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009440	TC	3	6	169506	169511	0 %	50 %	0 %	50 %	146302991
3002	NC_009440	CT	3	6	169566	169571	0 %	50 %	0 %	50 %	146302991
3003	NC_009440	GTTCTC	2	12	169584	169595	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146302991
3004	NC_009440	TCT	2	6	169683	169688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302991
3005	NC_009440	CTT	2	6	169753	169758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302991
3006	NC_009440	CTC	2	6	169764	169769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302991
3007	NC_009440	CTC	2	6	169860	169865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302991
3008	NC_009440	CT	3	6	170038	170043	0 %	50 %	0 %	50 %	146302991
3009	NC_009440	TCC	2	6	170080	170085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302991
3010	NC_009440	AGT	2	6	170190	170195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302992
3011	NC_009440	CTGGTC	2	12	170230	170241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302992
3012	NC_009440	TCC	2	6	170281	170286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302992
3013	NC_009440	AGAA	2	8	170342	170349	75 %	0 %	25 %	0 %	146302992
3014	NC_009440	GAC	2	6	170372	170377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302992
3015	NC_009440	CT	3	6	170547	170552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_009440	TAACA	2	10	170567	170576	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_009440	TAA	2	6	170644	170649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_009440	AG	3	6	170668	170673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_009440	GAA	2	6	170706	170711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302993
3020	NC_009440	GCG	2	6	170791	170796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302993
3021	NC_009440	GGC	2	6	171075	171080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146302994
3022	NC_009440	GGA	2	6	171092	171097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302994
3023	NC_009440	GCA	2	6	171398	171403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302995
3024	NC_009440	GA	4	8	171440	171447	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3025	NC_009440	ATGG	2	8	171458	171465	25 %	25 %	50 %	0 %	146302995
3026	NC_009440	GAA	2	6	171475	171480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302995
3027	NC_009440	AAGG	2	8	171514	171521	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3028	NC_009440	AAGC	2	8	171530	171537	50 %	0 %	25 %	25 %	146302995
3029	NC_009440	CATC	2	8	171540	171547	25 %	25 %	0 %	50 %	146302995
3030	NC_009440	AAG	3	9	171605	171613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302995
3031	NC_009440	CGA	2	6	171724	171729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302995
3032	NC_009440	AGG	2	6	171799	171804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302995
3033	NC_009440	AGA	2	6	171822	171827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302995
3034	NC_009440	CCA	2	6	171890	171895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302995
3035	NC_009440	TCC	2	6	171916	171921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302995
3036	NC_009440	CTG	2	6	171938	171943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302995
3037	NC_009440	GAGC	2	8	172024	172031	25 %	0 %	50 %	25 %	146302995
3038	NC_009440	ATA	2	6	172079	172084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302995
3039	NC_009440	TGA	2	6	172090	172095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302995
3040	NC_009440	AG	3	6	172141	172146	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3041	NC_009440	ATGG	2	8	172175	172182	25 %	25 %	50 %	0 %	146302995
3042	NC_009440	AG	3	6	172186	172191	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3043	NC_009440	GATA	2	8	172468	172475	50 %	25 %	25 %	0 %	146302995
3044	NC_009440	TCAG	2	8	172476	172483	25 %	25 %	25 %	25 %	146302995
3045	NC_009440	AG	3	6	172507	172512	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3046	NC_009440	GGA	2	6	172528	172533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302995
3047	NC_009440	GA	4	8	172573	172580	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3048	NC_009440	AG	3	6	172649	172654	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3049	NC_009440	ACT	2	6	172683	172688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302995
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3052	NC_009440	TC	3	6	172822	172827	0 %	50 %	0 %	50 %	146302995
3053	NC_009440	TTC	2	6	172904	172909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302995
3054	NC_009440	GA	3	6	172967	172972	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3055	NC_009440	GATG	2	8	172996	173003	25 %	25 %	50 %	0 %	146302995
3056	NC_009440	GTT	2	6	173024	173029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302995
3057	NC_009440	GTAC	2	8	173104	173111	25 %	25 %	25 %	25 %	146302995
3058	NC_009440	AAG	2	6	173159	173164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302995
3059	NC_009440	CT	3	6	173169	173174	0 %	50 %	0 %	50 %	146302995
3060	NC_009440	CGCGA	2	10	173339	173348	20 %	0 %	40 %	40 %	146302995
3061	NC_009440	GA	3	6	173353	173358	50 %	0 %	50 %	0 %	146302995
3062	NC_009440	CAA	2	6	173373	173378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302995
3063	NC_009440	GAT	2	6	173443	173448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302995
3064	NC_009440	AGAC	2	8	173495	173502	50 %	0 %	25 %	25 %	146302995
3065	NC_009440	GA	3	6	173539	173544	50 %	0 %	50 %	0 %	146302996
3066	NC_009440	AAG	2	6	173627	173632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302996
3067	NC_009440	AAG	2	6	173830	173835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_009440	ATG	2	6	173891	173896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_009440	CTC	2	6	173900	173905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_009440	CAAGG	2	10	173917	173926	40 %	0 %	40 %	20 %	146302997
3071	NC_009440	CTT	2	6	173968	173973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302997
3072	NC_009440	CCT	2	6	174013	174018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302997
3073	NC_009440	AGG	3	9	174059	174067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302997
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3075	NC_009440	GGA	2	6	174108	174113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302997
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3081	NC_009440	A	7	7	174538	174544	100 %	0 %	0 %	0 %	146302997
3082	NC_009440	GTT	2	6	174609	174614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302997
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3084	NC_009440	TGAGC	2	10	174651	174660	20 %	20 %	40 %	20 %	146302997
3085	NC_009440	GATCCC	2	12	174661	174672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146302997
3086	NC_009440	GAACGA	2	12	174696	174707	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146302997
3087	NC_009440	AG	3	6	174738	174743	50 %	0 %	50 %	0 %	146302997
3088	NC_009440	ATTTG	2	10	174847	174856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_009440	TC	3	6	174990	174995	0 %	50 %	0 %	50 %	146302998
3090	NC_009440	GAT	2	6	175027	175032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302998
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3093	NC_009440	GAG	2	6	175153	175158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302998
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3095	NC_009440	CCAA	2	8	175177	175184	50 %	0 %	0 %	50 %	146302998
3096	NC_009440	ACT	2	6	175249	175254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302998
3097	NC_009440	TAT	2	6	175269	175274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302998
3098	NC_009440	TAC	2	6	175328	175333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302998
3099	NC_009440	A	6	6	175415	175420	100 %	0 %	0 %	0 %	146302998
3100	NC_009440	TTG	2	6	175424	175429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302998
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3103	NC_009440	ATC	2	6	175495	175500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302998
3104	NC_009440	CAT	2	6	175519	175524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302999
3105	NC_009440	CAA	2	6	175738	175743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302999
3106	NC_009440	AGAGG	2	10	175772	175781	40 %	0 %	60 %	0 %	146302999
3107	NC_009440	ACT	2	6	175918	175923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302999
3108	NC_009440	TTC	2	6	176097	176102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302999
3109	NC_009440	GGA	2	6	176154	176159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302999
3110	NC_009440	GGT	2	6	176278	176283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302999
3111	NC_009440	GGA	2	6	176344	176349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302999
3112	NC_009440	GAG	2	6	176369	176374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302999
3113	NC_009440	AG	3	6	176389	176394	50 %	0 %	50 %	0 %	146302999
3114	NC_009440	AGGG	2	8	176411	176418	25 %	0 %	75 %	0 %	146302999
3115	NC_009440	AGGA	2	8	176432	176439	50 %	0 %	50 %	0 %	146302999
3116	NC_009440	GAG	2	6	176492	176497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302999
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3118	NC_009440	TCT	2	6	176601	176606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302999
3119	NC_009440	TGG	2	6	176689	176694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302999
3120	NC_009440	AGG	2	6	176803	176808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303000
3121	NC_009440	ATT	2	6	176896	176901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303000
3122	NC_009440	AAGG	2	8	176912	176919	50 %	0 %	50 %	0 %	146303000
3123	NC_009440	ATG	2	6	177207	177212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303000
3124	NC_009440	GTT	2	6	177219	177224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303000
3125	NC_009440	TCT	2	6	177304	177309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303000
3126	NC_009440	AG	3	6	177321	177326	50 %	0 %	50 %	0 %	146303000
3127	NC_009440	CAGC	2	8	177328	177335	25 %	0 %	25 %	50 %	146303000
3128	NC_009440	AGG	2	6	177403	177408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303000
3129	NC_009440	AGG	2	6	177424	177429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303000
3130	NC_009440	AGC	2	6	177515	177520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303000
3131	NC_009440	GGTT	2	8	177570	177577	0 %	50 %	50 %	0 %	146303000
3132	NC_009440	TCAC	2	8	177604	177611	25 %	25 %	0 %	50 %	146303000
3133	NC_009440	AG	3	6	177919	177924	50 %	0 %	50 %	0 %	146303001
3134	NC_009440	CAG	2	6	177946	177951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303001
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3154	NC_009440	TTC	2	6	179135	179140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303002
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3162	NC_009440	AGT	2	6	179616	179621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303002
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3226	NC_009440	GAAA	2	8	183414	183421	75 %	0 %	25 %	0 %	146303006
3227	NC_009440	TAC	2	6	183436	183441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303006
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3230	NC_009440	GTA	2	6	183635	183640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303006
3231	NC_009440	TGG	2	6	183700	183705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303007
3232	NC_009440	GGA	2	6	183720	183725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303007
3233	NC_009440	AAAG	2	8	183755	183762	75 %	0 %	25 %	0 %	146303007
3234	NC_009440	TTC	2	6	183767	183772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303007
3235	NC_009440	GGAA	2	8	183813	183820	50 %	0 %	50 %	0 %	146303007
3236	NC_009440	AGG	2	6	183874	183879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303007
3237	NC_009440	CCT	2	6	183890	183895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303007
3238	NC_009440	TCA	2	6	183982	183987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303007
3239	NC_009440	A	7	7	183987	183993	100 %	0 %	0 %	0 %	146303007
3240	NC_009440	GTGG	2	8	184020	184027	0 %	25 %	75 %	0 %	146303007
3241	NC_009440	TCA	2	6	184106	184111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303007
3242	NC_009440	TTACC	2	10	184115	184124	20 %	40 %	0 %	40 %	146303007
3243	NC_009440	AGG	2	6	184147	184152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303007
3244	NC_009440	GGGA	2	8	184196	184203	25 %	0 %	75 %	0 %	146303007
3245	NC_009440	TCA	2	6	184234	184239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303007
3246	NC_009440	GTT	2	6	184251	184256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303007
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3259	NC_009440	TCT	2	6	184908	184913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3495	NC_009440	AGAA	2	8	198719	198726	75 %	0 %	25 %	0 %	146303023
3496	NC_009440	CTAG	2	8	198747	198754	25 %	25 %	25 %	25 %	146303023
3497	NC_009440	CTC	2	6	198767	198772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303023
3498	NC_009440	A	6	6	198820	198825	100 %	0 %	0 %	0 %	146303023
3499	NC_009440	GAA	2	6	198830	198835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303023
3500	NC_009440	AT	3	6	198876	198881	50 %	50 %	0 %	0 %	146303023

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